Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Sfxn4Q925N1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sfxn4Q925N1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms