Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms