Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim59Q922Y2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms