Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp3Q91W36 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp3Q91W36 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms