Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd3Q91W18 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms