Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms