Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smg8Q8VE18 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg8Q8VE18 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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