Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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