Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8R3C1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8R3C1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms