Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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