Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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