Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf183Q8QZS5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms