Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms