Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms