Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne4Q8CII8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne4Q8CII8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms