Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Slc43a2Q8CGA3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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