Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo43Q8CDI2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms