Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Parp9Q8CAS9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Parp9Q8CAS9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms