Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ubqln3Q8C5U9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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