Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms