Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc2Q8BZW8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms