Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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