Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Triml1Q8BVP1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms