Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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