Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3Q8BRE0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms