Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms