Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rbfox3Q8BIF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rbfox3Q8BIF2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rbfox3Q8BIF2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rbfox3Q8BIF2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbfox3Q8BIF2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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