Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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