Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim6Q8BGE7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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