Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms