Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Htatsf1Q8BGC0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htatsf1Q8BGC0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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