Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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