Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H2-M10.5Q85ZW7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M10.5Q85ZW7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H2-M10.5Q85ZW7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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