Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lamp3Q7TST5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms