Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms