Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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