Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms