Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb10Q6XAR7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms