Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms