Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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