Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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