Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms