Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC061212Q6P8K3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms