Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mvb12bQ6KAU4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mvb12bQ6KAU4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mvb12bQ6KAU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mvb12bQ6KAU4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mvb12bQ6KAU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms