Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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