Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc2Q69ZB8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc2Q69ZB8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms