Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cntn4Q69Z26 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms