Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcg1Q64343 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Abcg1Q64343 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Abcg1Q64343 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Abcg1Q64343 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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