Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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