Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3bQ62177 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms